佐藤警官回忆起了三年前发生的事情,当时她所在的搜查科来了一位叫松田阵平的警官,在目暮警官的要求下,她便常常和松田一起行动。某日,警局再次收到了连续三年都在这一天发来的传真,看过内容后,松田不由分说的赶去摩天轮,并在那里发现了炸弹,为给四年前因炸弹而死的朋友荻原研二报仇,他只身犯险,却不幸殉职。这时,柯南他们的声音打断了佐藤的回忆,一起吃饭的路上又遇到了高木和白鸟警官,岂料悲剧再度发生。 白鸟警官的车突然发生爆炸,所幸他并没有当场死亡而是被立马送去了医院,在他的手中,佐藤警官还发现一封和三年前相似风格的挑战书,为了寻找炸弹,警察在慌乱中展开调查,柯南也从佐藤警官那里得知了,这个爆炸狂与警察的渊源,七年前警察和两名歹徒产生了误会,而导致其中一人出车祸死亡,于是这名活下来的歹徒便安放炸弹报复警察。 少年侦探队为帮白鸟警官报仇,坚持留下来和警察一起进行破案,根据歹徒留下来的警告信,警方认为炸弹就安在红色的电车上,可是费尽力气找到的全都是用来混淆视听的假炸弹,如果找不到炸弹,住在东京区的1200万居民都将成为人质,柯南再次仔细琢磨这封警告信,发现歹徒所指的地方就是东都塔,并且那里也已经发生了一次小型爆炸。高木警官和柯南冲入东都塔,成功将困在电梯的女孩解救,但他们两人就没有那么幸运了,柯南发现装在炸弹上的水银汞柱已经启动! 因为歹徒在炸弹上装了窃听器,可以听到他们的一举一动,只要他们一逃走,歹徒就会马上引爆炸弹,于是,柯南建议将炸弹拆除,期间,他突然想起了关于另外一枚炸弹的线索,便和高木警官稍作商量,为正在窃听他们的歹徒演上一出戏,眼看炸弹上的时间一点点流逝,柯南和高木警官能否瞒过歹徒安全逃脱?而另一边,目暮警官在天桥上将爆炸狂逮捕,他是如何得知歹徒的位置,又是根据什么推断出另外一枚炸弹的位置呢?